窪田規一

窪田規一氏は1976年4月に日産自動車へ入社し、1978年7月にスペシアルレファレンスラボラトリー（現エスアールエル）に転じた。以後はCROと診断の業界で約30年の経験を積んでいる。2000年11月にはJGSの設立に専務取締役として加わり、2001年4月に同社の代表取締役社長へ就任した。

2005年9月、東京大学エッジキャピタルと東京大学TLOの紹介で、フレキシザイムの開発者である菅裕明氏と出会った。両氏が語り合ったのは、技術では欧米に伍しながら事業では後れをとる日本のバイオ業界の閉塞感と、創薬の新しい方向である。共有した目標は日本発・世界初の新薬を生み出して社会に貢献することで、バイオ創薬の独創的な製薬会社への成長を掲げた。窪田規一氏は後年、病気に苦しむ人に感謝される仕事をしたいという夢を分かち合ったことが創業のきっかけだったと記している。2006年7月、ペプチドリームは東京都千代田区で設立され、ラボは東京大学先端科学技術研究センター内に置かれた。設立当初の資金は創業メンバーとエンジェル投資家が拠出し、外部の資本に依存しなかった。

設立後に最初に固めたのは技術の権利である。2006年12月に東京大学からフレキシザイムを中心とする技術の、2007年5月にはニューヨーク州立大学から基本特許の、いずれも第三者へのサブライセンス権付きの独占実施・許諾権を取得した。同じ2007年5月には英Cambridge Antibody Technologyと基礎研究契約を締結し、最初の提携先を得た。D体やNメチルのアミノ酸を含むペプチドを「特殊ペプチド」と名付けたのは窪田規一氏で、会社はこれを医薬品候補の素材に定めた。2010年4月に本社とラボを東京大学駒場リサーチキャンパスへ移し、同年10月に創薬開発プラットフォームPDPSを確立した。

収益の型は、製薬企業との共同研究開発契約で探索の初期から対価を受け取る設計にある。PDPSの利用対価として契約一時金を、標的分子ごとに研究開発支援金を前受けで受領し、候補物質の開発が進めば創薬開発権利金、目標達成報奨金、売上ロイヤルティへとつながる。売上の立ちにくい予備評価とされてきた段階から収入を得る点が、従来のバイオベンチャーとの違いであった。2010年にはブリストル・マイヤーズ スクイブ、アムジェン、田辺三菱製薬と相次いで契約を締結し、2011年以降は毎期黒字を確保した。

2013年6月、設立から7年で東証マザーズへ上場した。同年9月にはブリストル・マイヤーズ スクイブとPDPS技術ライセンス契約を締結し、共同研究に加えて創薬基盤そのものを貸与する収益源を設けた。技術貸与の相手は2015年のノバルティス、2016年のイーライリリーとジェネンテック、2017年の塩野義製薬へと広がった。2015年12月に東証一部へ市場を変更し、2017年9月には塩野義製薬・積水化学工業との合弁でペプチスターを設立して、原薬製造の体制を自ら整えた。