スギ薬局を展開するのはスギホールディングスのグループ会社である。スギホールディングス自身に親会社はなく、筆頭株主は資産管理会社のスギ商事で37.42%（2026年2月）を保有する。
資本政策における重要な意思決定 2024年 阪神調剤グループの買収 詳細を読む 歴代の筆頭株主 2006年から2025年・5時点
| 時点 | 筆頭株主 | 持株比率 |
|---|---|---|
| 2006年2月時点 | 杉浦 広一 | 13.56% |
| 2008年2月時点 | 杉浦 広一 | 12.8% |
| 2013年2月時点 | スギ商事 | 28.87% |
| 2020年2月時点 | スギ商事 | 33.33% |
| 2025年2月時点 | スギ商事 | 37.43% |
大株主の推移（2006年-2026年）
| 順位 | 2000年調査中 | 2005年（2006/2） | 2010年（2008/2） | 2015年（2013/2） | 2020年（2020/2） | 2025年（2025/2） |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | - | 杉浦 広一13.56% | 杉浦 広一12.80% | スギ商事28.87% | スギ商事33.33% | スギ商事37.43% |
| 2 | - | イオン10.98% | イオン10.36% | 11.81% | 3.81% | 10.29% |
| 3 | - | 杉浦 昭子10.97% | 杉浦 昭子10.35% | 3.05% | 杉浦 克典3.06% | 5.00% |
| 4 | - | スギ商事10.03% | スギ商事9.47% | 杉浦 広一2.98% | 杉浦 伸哉3.06% | 3.11% |
| 5 | - | 杉浦 克典4.33% | 杉浦 克典4.09% | 杉浦 昭子2.98% | - | - |
| 6 | - | 杉浦 伸哉4.33% | 杉浦 伸哉4.09% | 杉浦 克典2.98% | - | 2.95% |
| 7 | - | 3.73% | 3.88% | 杉浦 伸哉2.98% | ツルハ2.05% | SMBC日興証券1.73% |
| 8 | - | ツルハ2.12% | 2.54% | ツルハ2.00% | - | - |
| 9 | - | 2.10% | 野村信託銀行2.12% | 2.80% | 1.88% | - |
| 10 | - | 1.11% | ツルハ2.00% | 1.92% | 1.86% | ツルハ1.25% |
| （当時: スギ薬局）有価証券報告書（2006年2月期） | （当時: スギ薬局）有価証券報告書（2008年2月期） | （当時: スギホールディングス）有価証券報告書（2013年2月期） | （当時: スギホールディングス）有価証券報告書（2020年2月期） | （当時: スギホールディングス）有価証券報告書（2025年2月期） |
前半（1950〜2000年）は10年刻み、直近20年（2005〜2025年）は5年刻みのスナップショット。1980年以前は外部の歴史的史料（株式会社年鑑、会社年鑑等）、それ以降は有価証券報告書を出典とする。比率は各期の総発行株式数に対して算出。
直近10年の大株主（2016年-2026年）
筆頭（1位）2〜3位数値は持株比率(%)／保有株数。株主名をクリックで正式名称を表示
| 株主名 | FY152016/2 | FY162017/2 | FY172018/2 | FY182019/2 | FY192020/2 | FY202021/2 | FY212022/2 | FY222023/2 | FY232024/2 | FY242025/2 | FY252026/2 | FY26 | FY27 | FY28 | FY29 | FY30 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 28.87%18,288,000株 | 28.87%18,288,000株 | 28.87%18,288,000株 | 33.33%20,605,000株 | 33.33%20,605,000株 | 33.33%20,605,000株 | 33.92%20,972,000株 | 34.76%20,972,000株 | 37.42%22,577,000株 | 37.43%67,731,000株 | 37.42%67,731,000株 | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | 3.33%2,062,000株 | 3.81%2,357,000株 | 6.27%3,878,000株 | 10.42%6,442,000株 | 10.52%6,349,000株 | 10.96%6,615,000株 | 10.29%18,626,000株 | 9.55%17,290,000株 | - | - | - | - | - | |
| 3.90%2,475,000株 | 4.53%2,870,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | 2.56%1,625,000株 | 4.46%2,827,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| 4.26%2,700,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | 2.62%1,659,000株 | 3.38%2,143,000株 | 1.63%1,013,000株 | - | 1.75%1,086,000株 | 3.43%2,125,000株 | 3.92%2,365,000株 | 3.13%1,889,000株 | 3.05%5,525,000株 | 2.91%5,280,000株 | - | - | - | - | - | |
| 2.98%1,892,000株 | 2.98%1,892,000株 | 2.98%1,892,000株 | 3.06%1,892,000株 | 3.06%1,892,000株 | 3.06%1,892,000株 | 3.06%1,892,000株 | 3.13%1,892,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | 3.14%1,947,000株 | 2.10%1,299,000株 | 1.64%1,015,000株 | 1.47%912,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | 3.67%2,327,000株 | 3.61%2,291,000株 | 2.98%1,845,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | - | - | - | - | - | 5.00%3,019,000株 | 5.00%9,057,000株 | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 5.00%9,057,000株 | - | - | - | - | - | |
| 2.12%1,347,000株 | - | 2.33%1,481,000株 | - | 1.86%1,153,000株 | 2.68%1,658,000株 | 1.69%1,046,000株 | 2.27%1,374,000株 | 2.93%1,772,000株 | 2.95%5,341,000株 | 4.44%8,049,000株 | - | - | - | - | - | |
| 2.98%1,892,000株 | 2.98%1,892,000株 | 2.98%1,892,000株 | 3.06%1,892,000株 | 3.06%1,892,000株 | 3.06%1,892,000株 | 3.06%1,892,000株 | 3.13%1,892,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | - | - | - | 2.33%1,445,000株 | 1.42%860,000株 | 3.65%2,203,000株 | 3.11%5,632,000株 | 2.23%4,037,000株 | - | - | - | - | - | |
| 2.98%1,892,000株 | 2.98%1,892,000株 | 2.98%1,892,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | - | 2.17%1,346,000株 | 2.38%1,472,000株 | 2.63%1,627,000株 | 2.59%1,567,000株 | 1.85%1,118,000株 | - | - | - | - | - | - | - | |
| 2.98%1,892,000株 | 2.98%1,892,000株 | 2.98%1,892,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | 2.05%1,272,000株 | 2.05%1,272,000株 | 2.05%1,272,000株 | 2.05%1,272,000株 | 2.10%1,272,000株 | 2.10%1,272,000株 | 1.25%2,266,000株 | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | 2.72%1,724,000株 | 2.41%1,490,000株 | 1.88%1,163,000株 | 1.94%1,199,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | - | - | - | - | 1.36%821,000株 | 1.39%843,000株 | 1.65%2,988,000株 | 1.80%3,272,000株 | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.73%3,126,000株 | 1.54%2,801,000株 | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | 1.78%1,105,000株 | 1.92%1,187,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.38%2,493,000株 | 1.72%3,122,000株 | - | - | - | - | - | |
| 2.37%1,503,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| 2.21%1,401,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | 2.32%1,474,000株 | - | - | - | - | - | - | 1.07%648,000株 | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.52%2,753,000株 | - | - | - | - | - |
有価証券報告書「大株主の状況」の上位 10 位をもとに作成。株主名は NFKC 正規化と「株式会社」「（信託口）」等の除去で名寄せしているが、 合併・社名変更・信託口番号変更などで別行になることがある。持株比率は発行済株式総数から自己株式等を控除して算出する場合があり、控除の基準は社によって違う。