東映アニメーションの筆頭株主は東映で、34.32%（2026年3月）を保有する。1956年7月、東映が短編の外注先だった日動映画を買収して商号を東映動画へ改め、長編漫画映画の専属スタジオとした。2000年12月には東映の傘下に留まったまま店頭市場へ株式を公開している。
資本政策における重要な意思決定 2000年 東映子会社のまま上場 詳細を読む大株主の推移（2006年-2026年）
| 順位 | 2000年調査中 | 2005年（2006/3） | 2010年（2011/3） | 2015年（2015/3） | 2020年（2020/3） | 2025年（2025/3） |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | - | 東映32.00% | 東映33.57% | 東映33.57% | 東映34.17% | 東映34.17% |
| 2 | - | テレビ朝日14.29% | テレビ朝日15.07% | テレビ朝日15.07% | テレビ朝日20.00% | テレビ朝日20.00% |
| 3 | - | フジテレビジョン7.14% | 10.07% | 10.07% | 11.00% | 8.31% |
| 4 | - | 3.87% | 7.25% | 9.45% | 10.25% | - |
| 5 | - | 東日本電信電話3.71% | 東映ビデオ3.18% | 東映ビデオ3.25% | 東映ビデオ3.31% | 東映ビデオ3.31% |
| 6 | - | 2.86% | 東映ラボ・テック2.50% | 東映ラボ・テック2.50% | 東映ラボ・テック2.54% | 2.76% |
| 7 | - | 東映ラボ・テック2.50% | 2.05% | 2.39% | 1.89% | 東映ラボ・テック2.54% |
| 8 | - | 東映ビデオ2.50% | 2.00% | 2.00% | 1.89% | 1.94% |
| 9 | - | 2.00% | 1.86% | 1.86% | 1.40% | 1.89% |
| 10 | - | 1.95% | みずほ信託銀行1.86% | 1.86% | 0.94% | 1.78% |
| （当時: 東映アニメーション）有価証券報告書（2006年3月期） | （当時: 東映アニメーション）有価証券報告書（2011年3月期） | （当時: 東映アニメーション）有価証券報告書（2015年3月期） | （当時: 東映アニメーション）有価証券報告書（2020年3月期） | （当時: 東映アニメーション）有価証券報告書（2025年3月期） |
前半（1950〜2000年）は10年刻み、直近20年（2005〜2025年）は5年刻みのスナップショット。1980年以前は外部の歴史的史料（株式会社年鑑、会社年鑑等）、それ以降は有価証券報告書を出典とする。比率は各期の総発行株式数に対して算出。
直近10年の大株主（2016年-2026年）
筆頭（1位）2〜3位数値は持株比率(%)／保有株数。株主名をクリックで正式名称を表示
| 株主名 | FY152016/3 | FY162017/3 | FY172018/3 | FY182019/3 | FY192020/3 | FY202021/3 | FY212022/3 | FY222023/3 | FY232024/3 | FY242025/3 | FY252026/3 | FY26 | FY27 | FY28 | FY29 | FY30 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 33.57%4,700,000株 | 33.57%4,700,000株 | 34.17%4,700,000株 | 34.17%14,100,000株 | 34.17%14,100,000株 | 34.17%14,100,000株 | 34.17%14,100,000株 | 34.17%14,100,000株 | 34.17%14,100,000株 | 34.17%70,500,000株 | 34.32%70,800,000株 | - | - | - | - | - | |
| 15.07%2,110,000株 | 15.07%2,110,000株 | 20.00%2,750,000株 | 20.00%8,250,000株 | 20.00%8,250,000株 | 20.00%8,250,000株 | 20.00%8,250,000株 | 20.00%8,250,000株 | 20.00%8,250,000株 | 20.00%41,254,000株 | 20.00%41,254,000株 | - | - | - | - | - | |
| 10.07%1,410,000株 | 10.07%1,410,000株 | 10.25%1,410,000株 | 10.25%4,230,000株 | 10.25%4,230,000株 | 10.25%4,230,000株 | 10.25%4,230,000株 | 8.31%3,430,000株 | 8.31%3,430,000株 | 8.31%17,150,000株 | 3.19%6,575,000株 | - | - | - | - | - | |
| 2.00%280,000株 | 2.00%280,000株 | 11.00%1,512,000株 | 11.00%4,537,000株 | 11.00%4,537,000株 | 11.00%4,537,000株 | 11.00%4,537,000株 | 11.00%4,537,000株 | 2.76%1,139,000株 | 2.76%5,697,000株 | 2.76%5,697,000株 | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 4.90%10,100,000株 | - | - | - | - | - | |
| 9.51%1,331,000株 | 9.30%1,302,000株 | 1.89%260,000株 | 1.89%780,000株 | 1.89%780,000株 | 1.89%780,000株 | 1.89%780,000株 | 1.94%800,000株 | 1.94%800,000株 | 1.94%4,000,000株 | 1.94%4,000,000株 | - | - | - | - | - | |
| 3.25%454,000株 | 3.25%454,000株 | 3.31%454,000株 | 3.31%1,364,000株 | 3.31%1,364,000株 | 3.31%1,364,000株 | 3.31%1,364,000株 | 3.31%1,364,000株 | 3.31%1,364,000株 | 3.31%6,823,000株 | 3.31%6,823,000株 | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | - | - | 2.72%1,121,000株 | 4.90%2,020,000株 | 4.90%2,020,000株 | 4.90%2,020,000株 | 4.90%10,100,000株 | - | - | - | - | - | - | |
| 3.57%499,000株 | 4.26%597,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| 2.50%350,000株 | 2.50%350,000株 | 2.54%350,000株 | 2.54%1,050,000株 | 2.54%1,050,000株 | 2.54%1,050,000株 | 2.54%1,050,000株 | 2.54%1,050,000株 | 2.54%1,050,000株 | 2.54%5,250,000株 | 2.54%5,250,000株 | - | - | - | - | - | |
| 1.86%260,000株 | 1.86%260,000株 | 1.89%260,000株 | 1.89%780,000株 | 1.89%780,000株 | 1.89%780,000株 | 1.89%780,000株 | 1.89%780,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | 1.48%204,000株 | - | 0.94%387,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | 0.79%324,000株 | - | - | 0.79%324,000株 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | |
| - | - | - | - | - | - | - | - | 1.17%482,000株 | - | 1.07%2,203,000株 | - | - | - | - | - |
有価証券報告書「大株主の状況」の上位 10 位をもとに作成。株主名は NFKC 正規化と「株式会社」「（信託口）」等の除去で名寄せしているが、 合併・社名変更・信託口番号変更などで別行になることがある。持株比率は発行済株式総数から自己株式等を控除して算出する場合があり、控除の基準は社によって違う。